MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919 plasmid pLOCK919

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021722	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021722	TTTG	2	8	1851	1858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021722	CTTA	2	8	1888	1895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021722	AC	3	6	1908	1913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021722	A	6	6	1928	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021722	A	7	7	1981	1987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021722	CCTAG	2	10	2065	2074	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021722	AGC	2	6	2186	2191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021722	GC	3	6	2229	2234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021722	T	7	7	2241	2247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021722	TGC	2	6	2259	2264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021722	ATG	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021722	CGTG	2	8	2546	2553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021722	CTCC	2	8	2597	2604	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_021722	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021722	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021722	CTTG	2	8	2816	2823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021722	GGT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021722	GTC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021722	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021722	CAT	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021722	CAT	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021722	AAG	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021722	AGG	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021722	AAATGA	2	12	4027	4038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021722	AGC	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021722	TTA	2	6	5463	5468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021722	T	7	7	5480	5486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021722	AGGA	2	8	5493	5500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021722	GA	3	6	5504	5509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021722	GTTA	2	8	5579	5586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021722	AGG	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021722	TGGC	2	8	5686	5693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021722	TCAAA	3	15	5757	5771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021722	T	7	7	7104	7110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021722	GGT	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021722	GAAG	2	8	7149	7156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021722	CAAA	2	8	7166	7173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021722	AGAA	2	8	7182	7189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021722	TC	3	6	10135	10140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021722	AC	3	6	10171	10176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021722	GATG	2	8	10213	10220	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021722	A	7	7	10315	10321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021722	AAG	2	6	10331	10336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021722	ACC	2	6	10377	10382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021722	A	6	6	10394	10399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021722	AG	3	6	10446	10451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021722	CAA	2	6	11290	11295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021722	GGT	2	6	11378	11383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021722	TAT	2	6	11389	11394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021722	GAG	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021722	TAA	2	6	15871	15876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021722	CAAG	2	8	15888	15895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021722	TAA	2	6	17098	17103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021722	TTA	2	6	17120	17125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021722	TA	3	6	17138	17143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021722	ATGA	2	8	17174	17181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021722	TCA	2	6	17198	17203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021722	T	6	6	17232	17237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021722	GAT	2	6	17256	17261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021722	A	7	7	17278	17284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021722	TGCT	2	8	17390	17397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021722	TTC	2	6	17452	17457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021722	AGTA	2	8	17934	17941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021722	TTAG	2	8	18054	18061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021722	GAT	2	6	18187	18192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021722	ACG	2	6	18212	18217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021722	AAT	2	6	18225	18230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021722	TGT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021722	AC	3	6	18273	18278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021722	CTT	2	6	18286	18291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021722	C	6	6	18941	18946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_021722	AAG	2	6	18954	18959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021722	TAA	2	6	19938	19943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021722	A	7	7	20064	20070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021722	T	6	6	20162	20167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021722	TCCG	2	8	20181	20188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021722	TTTA	2	8	20212	20219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021722	ACA	2	6	20295	20300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021722	CT	3	6	21842	21847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021722	TGT	2	6	21917	21922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021722	ATC	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021722	ATT	2	6	21962	21967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021722	A	6	6	21977	21982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021722	AT	3	6	24229	24234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021722	ACG	2	6	25125	25130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021722	CTC	2	6	25445	25450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021722	CAG	2	6	25479	25484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021722	CAA	2	6	25507	25512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021722	AAAT	2	8	25548	25555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021722	GAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021722	TGGC	2	8	25572	25579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021722	TCC	2	6	25905	25910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021722	ATTCA	2	10	25921	25930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021722	TGT	2	6	25977	25982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021722	ACGT	2	8	26043	26050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021722	AAGG	2	8	26075	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021722	T	6	6	28136	28141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021722	TCC	2	6	29361	29366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021722	CGA	2	6	29706	29711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021722	A	7	7	29711	29717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021722	T	7	7	29747	29753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.